Un nuovo metodo consentirà di sviluppare più rapidamente i farmaci

Un gruppo internazionale di scienziati provenienti da Francia, Stati Uniti e Russia ha sviluppato un nuovo metodo unico per la creazione di farmaci, che si differenzia da quelli attualmente esistenti per la sua rapidità. Grazie al nuovo metodo di modellazione delle interazioni tra proteine, sarà possibile accelerare il processo di sviluppo di vaccini e farmaci, e i biochimici avranno anche nuove potenzialità nella ricerca.

Ora gli scienziati si trovano di fronte al compito di sviluppare farmaci che non causino effetti collaterali, siano completamente assorbiti dall'organismo e distruggano solo le cellule malate. Per una cellula, le proteine sono il principale materiale da costruzione; in una cellula avvengono numerose interazioni (centinaia di migliaia) e lo studio di questi processi consentirà agli scienziati di sviluppare nuovi metodi per il trattamento di malattie pericolose e di creare nuovi materiali biologici per l'invenzione di farmaci.

Specialisti provenienti da diversi paesi, sotto la guida del professor Dmitry Kozakov della Stony Brook University, sono riusciti a creare e studiare un modello computerizzato in grado di calcolare le strutture formate durante l'interazione di due proteine a una velocità diverse volte superiore (il nuovo modello è decine di volte più veloce rispetto a sistemi simili esistenti oggi).

Secondo gli scienziati, gli studi di laboratorio sono piuttosto costosi, poiché richiedono reagenti e attrezzature costose. Per i piccoli gruppi di ricerca, l'opzione migliore è la modellazione computerizzata. Attualmente esistono molti sistemi informatici che calcolano l'interazione tra proteine, ma, sfortunatamente, non tutti i sistemi esistenti sono in grado di calcolare un gran numero di interazioni proteiche in tempi brevi. Tutti gli algoritmi attualmente utilizzati monitorano le configurazioni separatamente, senza combinarle, e il nuovo metodo del team del Professor Kozakov consente di analizzare tutti i complessi simultaneamente in tempi brevi, accelerando il processo fino a 100 volte senza compromettere la qualità del risultato finale.

Utilizzando un modello computerizzato come base, gli specialisti saranno in grado non solo di sviluppare farmaci più rapidamente, ma anche di ridurne significativamente i costi. Il nuovo metodo di modellazione computerizzata consente non solo di calcolare le interazioni proteiche, ma anche di analizzare la struttura degli organismi viventi (sia animali che umani). Secondo gli specialisti, il nuovo metodo consentirà di sviluppare farmaci efficaci contro l'HIV e le malattie oncologiche e in breve tempo sarà possibile preparare un numero sufficiente di farmaci.

Gli scienziati hanno pubblicato un articolo con i risultati del loro lavoro su una rivista scientifica, nel quale gli specialisti hanno descritto in dettaglio un nuovo metodo di modellazione computerizzata delle interazioni proteiche.

Questo lavoro non è destinato a uso commerciale, ma è uno studio fondamentale, quindi possiamo parlare del lavoro svolto fin dal momento della sua pubblicazione scientifica. Ora il nuovo algoritmo è già utilizzato sul server pubblico di ClusPro come nuovo sistema di calcolo ed è disponibile a tutti.

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