La determinazione degli anticorpi alla frazione microsomiale della ghiandola tiroidea viene utilizzata per diagnosticare la tiroidite autoimmune e l'ipotiroidismo, in cui il livello di anticorpi nel sangue aumenta. Gli anticorpi ai microsomi della tiroide formano complessi immuni sulla superficie cellulare, attivano il complemento e i linfociti citotossici, che portano alla distruzione cellulare e alla formazione di un processo infiammatorio nella ghiandola tiroidea.