H. Influenzae - cellule pleomorfe gram-negative a forma di bastoncello o coccoide (0,2-0,3) x (0,5-2) μm. Si trovano in tratti singolarmente o in coppia, e talvolta sotto forma di catene corte e gruppi. Su supporti densi, si formano colonie rotonde di piccole dimensioni (fino a 1 mm di diametro). I microrganismi sono immobili, non formano una spora, ma è possibile la formazione di forme capsulari con cui si legano le proprietà patogene. L'agente causale produce endotossina, il cui vettore è considerato polisaccaridi capsulari.