Molto spesso colite pseudomembranosa sviluppa sotto l'influenza di uso prolungato di antibiotici ampicillina, lincomicina, Klinda-mitsina, cefalosporine, almeno - penicillina, eritromicina, cloramfenicolo, tetracicline. Clostridium difficile - sporigeni bacillo anaerobico gram-positivi, in grado di produrre due tipi di esotossine tossina A e tossina B. Ci sono quattro motivi principali per lo sviluppo di colite pseudomembranosa associata a C. Difficile.