L'infezione batterica è uno dei fattori eziologici più importanti della colecistite cronica alitiasica. Le fonti di infezione possono essere malattie del rinofaringe e dei seni paranasali (tonsillite cronica, sinusite); del cavo orale (stomatite, gengivite, parodontite); dell'apparato urinario (cistite, pielonefrite); dell'apparato riproduttivo (prostatite, uretrite); malattie ginecologiche (annessite, endometrite); malattie infettive intestinali; danno epatico virale.
